Fecha de publicación: 2009-01-13 09:19:24

¿Porqué el Genoma está tan publicitado hoy día? La palabra “Genoma” ha aparecido en los encabezados de muchos artículos en las revistas de lechería durante los últimos meses. Los avances científicos en la tecnológica del secuenciamiento del ADN han permitido al Departamento de Agricultura de los EE.UU. (USDA) crear evaluaciones genéticas más confiables, mucho más temprano en la vida del animal. Este descubrimiento científico puede ser el evento de más impacto en la industria de la I.A. desde la introducción del semen congelado.

¿Qué es una Evaluación por Genoma? La evaluación genética de una animal se conforma de varios componentes. El pedigree del animal, el comportamiento del propio animal, el comportamiento de la progenie de ese animal, y ahora la información del ADN de ese animal. Todo esto contribuye a lo que hoy llamamos Evaluación por Genoma. Dependiendo de la cantidad de información disponible, cada uno de estos componentes influye en mayor o menor proporción en la evaluación genética oficial de un animal. Para decirlo en forma sencilla, el Genoma agrega la información de la composición real de ADN a la evaluación genética basada en el comportamiento. A esta combinación la llamamos Evaluación por Genoma.

¿Estamos convencidos de que esta tecnología impactará realmente? ¡SI! Ciencia de la mejor respalda esta tecnología. La utilización de herramientas similares en el desarrollo del genoma humano y vegetal ha demostrado ser beneficiosa. Varios estudios realizados por el USDA, así como investigaciones adicionales realizadas por Select Sires, han mostrado que el Genoma es de gran utilidad para tomar decisiones de selección genética acertadas mucho antes en la vida de los animales. En Select Sires, todas las decisiones genéticas en Holando y Jersey se realizan tomando en cuenta la información del Genoma del animal.

¿Los testeos Ingenity realizados previamente han sido ventajosos para Select Sires? Otra vez ¡SI! El perfil genético que proveía el Ingenity ayudó a todos en Select Sires a comprender y a aprender acerca de los SNP (Single Nucleotide Polymorphisms o Polimorfismo en Nucleótidos Simples), y como incorporar estos datos al proceso de selección genética. Además los perfiles genéticos Ingenity muestran una correlación positiva con las Evaluaciones por Genoma del USDA. Esto le dio a Select Sires tres años de ventaja en este tema respecto al resto de la industria. Además, Ingenity continua siendo el método para testear parentesco entre los toros probados y sus hijas. Una forma de dar mayor seguridad a la información de las pruebas de nuestros toros.

Entonces, ¿qué son exactamente los SNP? Los cromosomas contienen dos cadenas de ADN que a su vez contienen secuencias de cuatro pares de bases (Adenina, Timina, Guanina y Citosina). Un SNP, es cuando existe una diferencia en una sola de estas bases, Esta variación marca una diferencia en el ADN de una animal con otro. Los avances científicos han logrado que la tecnología de los SNP sea comercialmente utilizable, y por lo tanto han posibilitado la herramienta que llamamos Genoma.Los bovinos tienen 30 pares de cromosomas que a su vez contienen alrededor de 3 billones de estos pares de bases. Como es muy costoso identificar la secuencia de estos 3 billones de pares de bases, se miden grupos de estos pares de bases (estos grupos son llamados SNP). Illumina Inc., en asociación con el USDA, ha desarrollado un microchip que testea 50.000 de esos SNP, en un esfuerzo para condensar los 3 billones de pares de bases en una herramienta manejable.

¿Están todos los rasgos medidos por el USDA para todas las razas influenciados por el Genoma? El USDA va a ajustar 29 rasgos incluidos en las evaluaciones genéticas utilizando el Genoma. Esto incluye cinco rasgos de producción (Leche, Grasa, % Grasa, Proteína % Proteína), siete rasgos de salud (Vida Productiva, Escore de Células Somáticas, Tasa de Preñez de la Hijas, Facilidad de Parto del Toro, Facilidad de Parto de las Hijas, Mortinatos Toro y Mortinatos Hijas), 16 rasgos de conformación (Tipo y los 16 rasgos de la lineal) y Mérito Neto. Como todos estos rasgos varían en heredabilidad, la confiabilidad siempre ha sido diferente para cada uno de estos rasgos. El Genoma va a afectar en forma diferente la confiabilidad de cada uno de estos rasgos, los rasgos que se verán más favorecidos son los rasgos de salud, ellos tendrán los mayores incrementos de confiabilidad.

¿Se va a incorporar el Genoma a las evaluaciones genéticas de todo el mundo? La respuesta es, otra vez, si, pero en este caso con variaciones. La mayoría de los países proveedores de genética utilizan métodos similares para analizar los SNP. La diferencia está en los sistemas de computación que se utilizan en cada país. Lo mismo ocurre cuando comparamos pruebas entre países, hay diferencias en los sistemas. Estas diferencias que existen hoy día son manejadas de la mejor manera posible por el sistema de evaluación de Interbull. Sin embargo, por ahora la información de Genoma será aplicada solamente a los animales con prueba del USDA. Interbull no tiene aún un sistema que le permita manejar las evaluaciones por Genoma. Por lo tanto, las pruebas oficiales de los toros de otros países serán los HPT (PTA) corrientes, sin ajuste por Genoma, es decir las pruebas MACE:

¿Esto significa que los Promedios de Padres utilizados en el pasado no tienen valor alguno? En realidad, los promedios de padres son utilizados aún como parte fundamental de la Evaluación por Genoma. Cerca de la mitad de la Evaluación por Genoma de este Enero 2009, en el caso de los toros jóvenes, se basará en lo que anteriormente llamábamos Promedio de Padres. A esta evaluación (Promedio de Padres) que tenía una confiabilidad del 35 al 40%, se le agregará ahora la información de su ADN (información del Genoma), con lo que obtendremos la Evaluación por Genoma que tendrá mucho mayor confiabilidad. Por ejemplo, para la mayoría de los rasgos de producción la adicción la información del Genoma resultará en confiabilidades del 65 al 70% para los toros jóvenes.

¿La información del Genoma eliminará la necesidad de los programas de pruebas de toros jóvenes? El Programa para Avance Genético de Select Sires (PGA) es todavía vital para evaluar apropiada y totalmente cada uno de los toros comercializados con esta marca. Como lo establecimos antes, la información del Genoma nos ayudará a seleccionar cuales toros jóvenes se probarán en el sistema PGA. Pero vamos a seguir con nuestro programa de pruebas líder en la industria, para ofrecerle los toros graduados con el 85-90% de confiabilidad a los que están acostumbrados nuestros clientes. Ahora, con toros jóvenes con el 70% de confiabilidad en sus pruebas, el PGA seguramente tendrá un porcentaje mayor de toros graduados. Surge entonces la pregunta de si Select Sires debe mantener su programa de pruebas de más de 300 toros por año. Pensamos que mantener un programa de pruebas grande, ayudará a que Select Sires expanda aún más su genética a nivel mundial. El mercado creciente de Select Sires exige mayor cantidad de toros probados para cumplir con las necesidades de nuestros clientes.

¿Cuáles son los métodos para realizar este test? Actualmente el test de Genoma se realiza en sangre o muestras de pelo. Una muestre limpia se toma del animal en cuestión, la muestra se identifica apropiadamente con su número de identificación oficial, dicha muestra es enviada al proveedor para que realice el análisis del Genoma.

¿Puede cualquiera obtener la Evaluación por Genoma de sus animales, cómo y dónde? En los EE.UU. todas las hembras Holando y Jersey son elegibles para realizar este test de genoma. Hay que dirigirse a la Asociación de la raza que le proveerá el kit y las instrucciones. El kit es enviado para el testeo, luego de realizado el análisis, el USDA calculará la Evaluación por Genoma del animal y enviará los resultados al dueño. Testear machos es bastante más complicado. Desde hace casi 10 años, siete centros de I.A. de la NAAB, incluyendo a Select Sires, comenzaron un trabajo de colaboración con el USDA y el CDDR para comenzar a guardar muestras de cada toro joven que entraba en prueba con el fin de realizar test de ADN en el futuro. Este fue el comienzo de esta tecnología. Como parte de este acuerdo de colaboración, estos siete centros de I.A. tienen la exclusividad para realizar testeos en machos hasta Marzo del 2013.

¿Cómo sé si a un animal se le ha realizado el test de Genoma? Si un animal tiene el test de Genoma, su evaluación tendrá una G precediendo su PTA, TPI o JPI. Otro signo obvio para determinar si la información de Genoma ha sido incluida en su prueba, es revisar la confiabilidad de la misma. Los toros jóvenes tendrán confiabilidades de alrededor del 65%. Los toros probados recibirán un empuje en su confiabilidad. Los toros de Select Sires subirán como un 5% en su confiabilidad, ya que han sido todos testeados.

¿Cómo afectara el Genoma la adquisición de toros por parte de Select Sires? Todos los toros jóvenes Holando y Jersey serán testeados por Genoma antes de ser retirados de sus granjas de origen. Este testeo por Genoma ayudará a determinar el precio de estos toritos, y ayudará a determinar su potencial genético antes de ingresar al PGA. Todos los padres de toros utilizados en los apareamientos serán testeados, para comprobar que estos toros con sus primeras pruebas realmente tienen gran potencial genético. El testeo genómico de la hembras también aportará al permitir elegir a las mejores madres de toros, particularmente entre las hembras de menor edad. Esta tendencia a utilizar padres y madres más jóvenes, aumentará el progreso genético al reducir el intervalo entre generaciones.

¿Todos los animales en Select Sires estarán testeados por Genoma? Todos los toros probados que comercializa Select Sires ya han sido testeados por Genoma y están marcados de esa forma. Además, todos los toros jóvenes Holando y Jersey, sin importar si se están comercializando o no, están marcados con la G precediendo sus evaluaciones si han sido testeados. Esto asegura a los clientes de Select Sires que están adquiriendo semen de toros que tienen evaluaciones genéticas más avanzadas.

¿Con las altas confiabilidades de los toros jóvenes probados por genoma, no sería prudente dejar de usar toros probados con pruebas bajas y utilizar toros jóvenes probados por genoma? Primero, debemos enfatizar el hecho de que hasta que un toro no está totalmente probado por el PGA, las variaciones en su prueba, incluso para los testeados por Genoma, pueden y van a ocurrir. Aunque la información del ADN provee mayor confiabilidad a las pruebas, aún hay mucho que aprender. Por lo tanto, los toros graduados por el PGA son para nosotros el estándar por el cual medimos el progreso genético. Los toros jóvenes deben seguir siendo utilizados como grupos de toros. Pero, algunos toros jóvenes realmente de elite pueden ser seleccionados para ser utilizados en mayor proporción, aunque, utilizar más de un toro joven a la vez sigue siendo lo más prudente.